1582年，织田信长（中村桥之助 饰）一统天下近在咫尺，却遭家臣明智光秀叛变，在本能寺遇刺。信长的左臂右膀丰臣秀吉（奥田瑛二 饰）出兵讨伐光秀，并接下信长的遗志，树立起丰臣政权。世间还残留着战争的火种，却暂时获得了讴歌已久的和平。社会贫富差距增大，民不聊生。一名劫富济贫、仗义行侠的大盗横空出世，他的名字是石川五右卫门（江口洋介 饰）。身手不凡的五右卫门，立即成为了百姓心中的平民英雄。一天夜里，五右卫门在纪伊国屋文左卫门（六平直政 饰）的宅邸盗宝时，发现了一个南蛮制的箱子，偷出箱子后，五右卫门发现里面是空的，便从屋顶上丢了下去。贫穷人家的小平太（深泽岚 饰），意外拣到了箱子。次日，五右卫门从同伴猿飞佐助（Gori 饰）那里听说，石田三成（要润 饰）没能从纪伊国屋府拿到箱子，并派出手下雾隐才藏（大泽隆夫 饰）追寻箱子的下落。为了找回箱子，五右卫门来到了贫民区，正好撞上官差又八（玉山铁二 饰）斩杀小平太的母亲（鹤田真由 饰）。五右卫门不由得忆起父母被害的悲伤往事，于是，他拔刀切下了又八的手。突然，才藏带领着一群忍者们将他包围，五右卫门抱着箱子逃了出去。追赶中两人展开激战，信长一手栽培出的忍者服部半藏（寺岛进 饰），暗地将这一切都看在眼里。石田三成派出雾隐才藏，德川家康（伊武雅刀 饰）派出服部半藏，各方都为抢到箱子而争红了眼。箱子中隐藏着织田信长暗杀事件的秘密——真正的主谋是丰臣秀吉。得知真相的五右卫门，只身进入大阪城，用小太刀刺杀秀吉，混乱中意外与茶茶（广末凉子 饰）再会。而刚才被杀的秀吉，只是一个影武者。五右卫门打算遗忘的过去，重新敞开了大门。失去双亲的五右卫门，被信长救了一命，从此，将性命托付给对方，并和才藏一起接受忍者训练。信长遇害后，五右卫门为了自由而起程，与渴望成为武士的才藏分别。今天，在大阪城中再度与茶茶相见，又令五右卫门回忆起自己的幼年时代。在信长的安土城，五右卫门奉命担任少女茶茶（福田麻由子 饰）的护卫，并彼此抱有模糊的爱慕之心。与命运做斗争的五右卫门、梦想成为武士却受命运捉弄的雾隐才藏、权利在手并夺走五右卫门心上人的丰臣秀吉、策划暗杀秀吉的石田三成、为了终结战乱而横心的茶茶、企图开创新时代的德川家康与服部半藏，一场各怀情感、野心的大战，拉开了帷幕。